Kompetansekravene i § 3 gjelder ikke for leger som per 1. mars 2017 var fastleger eller ansatt i en stilling der det ytes helsehjelp etter helse- og omsorgstjenesteloven. Unntaket omfatter også leger som per 1. mars 2017 var i permisjon fra arbeid som fastlege eller i annen kommunal stilling. Disse legene er omfattet av overgangsordningen og unntatt fra kravet om spesialisering.
Det er også gjort unntak for leger som oppfylte kravene for godkjenning som allmennlege (lovdata.no). Det inkluderer leger som har fulgt den tidligere ordningen, men ikke har søkt om godkjenning som allmennlege. For å omfattes av kravet må legen kunne dokumentere tre års veiledet tjeneste, hvorav minst seks måneder er i sykehus og minst 6 måneder er i allmennmedisin. Det er ikke krav om å ha søkt eller fått en godkjenning som allmennlege, så lenge dokumentasjon på gjennomførte læringsaktiviteter foreligger og disse er fullført før forskriftens ikrafttredelse.