Ved lokoregional behandling av HCC hos pasient med ellers frisk lever er det risiko for blødning, infeksjon, gallegangsskade og redusert leverfunksjon. Har pasienten i tillegg cirrhose, er det økt risiko for leversvikt.
Systemisk behandling er også forbundet med risiko for bivirkninger og komplikasjoner som fatigue, diare, hånd- og fotsyndrom, blødning, kardiovaskulære hendelser og immunmedierte bivirkninger – de ulike regimene med forskjellig bivirkningsprofil.