Inklusjon i registeret er basert på informert samtykke som innhentes av den avdeling/praksis som behandler pasienten. Pasienter kan oppleve det som en ekstra trygghetsramme å bli inkludert i systematisk oppfølging via MS-registeret, allerede fra diagnosetidspunktet. Dersom informasjon om Norsk MS-register og biobank og innhenting av samtykke er utfordrende på diagnosetidspunktet, kan dette gjøres ved oppfølgende konsultasjoner.
Data kan legges inn i registerets nettbaserte registreringsløsning med en gang diagnosen er stilt, og samtykke kan innhentes ved diagnose eller på et senere tidspunkt. Data innsamlet uten samtykke kan benyttes til lokalt kvalitetsforbedringsarbeid ved aktuelle avdeling, men dataene eksporteres til Norsk MS-register og biobank (helse-bergen.no) sentralt først når samtykke er innhentet. Det er derfor viktig å ha gode rutiner for innhenting av samtykke.