Leder for LIS-en har ansvar for å godkjenne læringsmål og for å innhente anbefalinger fra veilederen og minst en av dem som har deltatt i supervisjonen. Leder kan delegere oppgaven med å godkjenne læringsmål, men ansvaret kan ikke delegeres. En leder i sykehus er den som har både faglig, administrativt og personellmessig ansvar i den enheten LIS-en er ansatt. En leder i kommunen vil både for en LIS ansatt i kommunen eller på et fastlegekontor som har avtale med kommunen, være en linjeleder i kommunens administrasjon, for eksempel en helse- og sosialsjef.
I høringsnotatet heter det at gjennomføring av vurdering og dokumentasjon om et læringsmål er oppnådd bør skje innen seks uker etter at de relevante læringsaktivitetene er gjennomført (Høringsnotat 2016, s. 124). Dette for å sikre en reell vurdering av kompetansen i "sanntid" og progresjon i læringsforløpet. Som påpekt andre steder i denne veilederen, kan det imidlertid være nødvendig å vente med godkjenning av enkelte læringsmål dersom det er viktig å se kompetansen i sammenheng.