For innlagte pasienter er laboratorietjenester finansiert gjennom rammetilskudd og innsatsstyrt finansiering (ISF).
For polikliniske pasienter kan det kreves refusjon fra Helseøkonomiforvaltningen (HELFO) for utførte laboratorietjenester. Det samme gjelder for private laboratorier. For de private laboratoriene er det en forutsetning for refusjon at laboratoriet har inngått avtale med et regionalt helseforetak om utførelse av slike tjenester.
I januar 2012 legges et nytt kodeverk for laboratoriefag ut på høring. Kodeverket blir tilgjengelig på direktoratets nettsider. Kodeverket skal brukes ved elektronisk rekvirering og svarformidling innen laboratoriefagene. Pilotering i forbindelse med Meldingsløftet pågår vinter 2011/2012.
Kodeverket for laboratoriefagene kan danne grunnlag for fremtidige endringer av finansieringssystemet for laboratoriefagene.